Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XylbQ3TNA1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms