Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xlr4cQ3TKR2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xlr4cQ3TKR2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms