Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc69Q3TCJ8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms