Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem248Q3TBN1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms