Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riiad1Q3KNY5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms