Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3KNL4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3KNL4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3KNL4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms