Protein–RNA interactions for Protein: Q2EG98

Pkd1l3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l3Q2EG98 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l3Q2EG98 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkd1l3Q2EG98 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms