Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lingo4Q149C3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Lingo4Q149C3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Lingo4Q149C3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Lingo4Q149C3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Lingo4Q149C3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Lingo4Q149C3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Lingo4Q149C3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lingo4Q149C3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms