Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp2b3Q0VF55 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms