Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms