Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd12Q0VE29 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms