Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem52bQ0VBF2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms