Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neurl1bQ0MW30 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms