Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms