Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pate4Q09098 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms