Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q08AU9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q08AU9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q08AU9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q08AU9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q08AU9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q08AU9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms