Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms