Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms