Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CbfbQ08024 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CbfbQ08024 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CbfbQ08024 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CbfbQ08024 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CbfbQ08024 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CbfbQ08024 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CbfbQ08024 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms