Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Caprin2Q05A80 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms