Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms