Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp11Q02853 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms