Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1sQ02789 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms