Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb5Q02739 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms