Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GscQ02591 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GscQ02591 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GscQ02591 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GscQ02591 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GscQ02591 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GscQ02591 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GscQ02591 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GscQ02591 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GscQ02591 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GscQ02591 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GscQ02591 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GscQ02591 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms