Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms