Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ascl1Q02067 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms