Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VcpQ01853 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms