Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nme2Q01768 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nme2Q01768 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms