Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms