Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf7Q00417 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf7Q00417 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms