Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms