Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp10Q000W5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms