Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
rp9P97762 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
rp9P97762 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
rp9P97762 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
rp9P97762 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
rp9P97762 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms