Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Meis3P97368 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Meis3P97368 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms