Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmsP97355 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmsP97355 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmsP97355 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmsP97355 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmsP97355 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmsP97355 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmsP97355 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmsP97355 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmsP97355 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmsP97355 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SmsP97355 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmsP97355 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmsP97355 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmsP97355 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SmsP97355 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmsP97355 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SmsP97355 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmsP97355 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SmsP97355 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmsP97355 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SmsP97355 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SmsP97355 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmsP97355 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmsP97355 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmsP97355 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SmsP97355 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms