Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pitx1P70314 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx1P70314 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms