Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp3P70281 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp3P70281 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms