Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad54lP70270 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms