Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf5P70191 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf5P70191 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf5P70191 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf5P70191 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf5P70191 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf5P70191 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms