Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtnP63089 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtnP63089 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtnP63089 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtnP63089 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtnP63089 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms