Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27aP62983 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27aP62983 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27aP62983 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27aP62983 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27aP62983 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps27aP62983 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps27aP62983 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps27aP62983 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps27aP62983 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps27aP62983 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27aP62983 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27aP62983 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27aP62983 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27aP62983 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27aP62983 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27aP62983 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27aP62983 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps27aP62983 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms