Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crabp1P62965 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms