Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3P62908 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms