Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps13P62301 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps13P62301 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps13P62301 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms