Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps11P62281 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps11P62281 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps11P62281 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps11P62281 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps11P62281 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps11P62281 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps11P62281 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps11P62281 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms