Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp46P62069 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms