Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lmo4P61969 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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