Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufm1P61961 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms