Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5r1P61809 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk5r1P61809 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk5r1P61809 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk5r1P61809 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms